Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klhl40Q9D783 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klhl40Q9D783 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klhl40Q9D783 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klhl40Q9D783 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Klhl40Q9D783 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Klhl40Q9D783 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Klhl40Q9D783 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms