Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cul5Q9D5V5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms