Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms