Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fndc8Q9D2H8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms