Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Mrpl28Q9D1B9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Mrpl28Q9D1B9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms