Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms