Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Shisa9Q9CZN4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shisa9Q9CZN4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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