Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufaf1Q9CWX2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms