Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Malsu1Q9CWV0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms