Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sft2d3Q9CSV6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sft2d3Q9CSV6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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