Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms