Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Chchd1Q9CQA6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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