Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tdrd1Q99MV1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms