Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt84Q99M73 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt84Q99M73 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms