Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rab28Q99KL7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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Rab28Q99KL7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab28Q99KL7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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