Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dok4Q99KE3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Dok4Q99KE3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Dok4Q99KE3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dok4Q99KE3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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