Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ddb2Q99J79 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111 ms