Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Xrcc4Q924T3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Xrcc4Q924T3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms