Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Csmd1Q923L3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Csmd1Q923L3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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