Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim59Q922Y2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim59Q922Y2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms