Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Traf7Q922B6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms