Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Krt79Q8VED5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Krt79Q8VED5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Krt79Q8VED5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt79Q8VED5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms