Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttc8Q8VD72 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc8Q8VD72 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms