Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Q8VCE4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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