Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim29Q8R2Q0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms