Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Vmn1r200Q8R281 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms