Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Impg1Q8R1W8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms