Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Hoxc12Q8K5B8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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Hoxc12Q8K5B8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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