Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Casc3Q8K3W3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Casc3Q8K3W3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms