Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MyripQ8K3I4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MyripQ8K3I4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms