Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Alkbh6Q8K2U2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Alkbh6Q8K2U2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Alkbh6Q8K2U2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Alkbh6Q8K2U2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Alkbh6Q8K2U2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Alkbh6Q8K2U2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Alkbh6Q8K2U2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Alkbh6Q8K2U2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Alkbh6Q8K2U2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms