Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brd3Q8K2F0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms