Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Abcf3Q8K268 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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