Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cldn34c1Q8K193 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn34c1Q8K193 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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