Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SbsnQ8CIT9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SbsnQ8CIT9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms