Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ccdc38Q8CDN8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc38Q8CDN8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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