Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc19Q8CC21 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms