Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8C708 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Q8C708 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Q8C708 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Q8C708 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms