Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx17Q8BVL3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx17Q8BVL3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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