Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdcl3Q8BVF2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms