Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Usp1Q8BJQ2 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp1Q8BJQ2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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