Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cyp4f39Q8BGU0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cyp4f39Q8BGU0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms