Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChfrQ810L3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ChfrQ810L3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ChfrQ810L3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ChfrQ810L3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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ChfrQ810L3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms