Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ell3Q80VR2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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