Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Dsg1bQ7TSF1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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