Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pdcl2Q78Y63 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdcl2Q78Y63 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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