Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Topbp1Q6ZQF0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms