Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Atp8b3Q6UQ17 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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