Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NfrkbQ6PIJ4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms