Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smchd1Q6P5D8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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